Helixfold
Piega una catena di residui lungo una griglia in modo che le unità idrofobiche si raggruppino in un nucleo sepolto e spremano l'energia fino al minimo comprovato.
Come giocare
Una proteina è modellata come una catena di residui idrofobici (H) e polari (P) su un reticolo 2D. I vicini idrofobici che siedono adiacenti senza essere legati abbassano l’energia. Il tuo obiettivo è piegare la catena in modo che i residui H formino un nucleo compatto e raggiunga l'energia ottimale.
- Fare clic su un residuo per ruotare attorno ad esso la coda della catena.
- Fai clic alternativamente sullo stesso residuo per ruotare nella direzione opposta.
- Utilizza il pulsante Gira per invertire la direzione di rotazione predefinita (in senso orario/antiorario).
- Raggiungi l'energia minima dimostrabile affinché la catena vinca il puzzle.
Controlli
- Desktop: fai clic sui residui per ruotare, fai nuovamente clic per invertire, attiva/disattiva Ruota e utilizza Ripristina per raddrizzare.
- Telefono e tablet: tocca i residui per ruotare: completamente touch-friendly.
Suggerimenti e strategia
- Conta i contatti H-H, non la forma: ogni coppia idrofobica non legata che finisce adiacente fa cadere l'energia.
- Mira a una massa compatta piuttosto che a un braccio lungo; la superficie esposta dai residui H è energia sprecata.
- Quando una piega si blocca, ripristina e prova prima a seminare il nucleo dal gruppo più denso di residui H.
Cosa imparerai
Helixfold è costruito sul classico modello reticolare idrofobo-polare del ripiegamento delle proteine, trasformando la ricerca di una piega in un puzzle.
- Competenze: biochimica, ripiegamento delle proteine, modello HP, ottimizzazione
- Ideale per: scuola superiore/università avanzata
- Per genitori e insegnanti: il modello HP del ripiegamento delle proteine.
A proposito di Helixfold
Helixfold si basa sul classico modello reticolare idrofobo-polare del ripiegamento delle proteine, trasformando la ricerca di una conformazione a energia minima in un puzzle tattile. È un browser game originale e gratuito con tre lunghezze di catena e modalità di allenamento giornaliere e più.
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