Seppellisci insieme i residui timorosi dell'acqua e osserva l'energia cadere.
Ti viene data una catena di residui, alcuni idrofobici (H) e altri no. Piegalo sulla griglia in modo che i residui idrofobici si raggruppino in un nucleo sepolto: ogni coppia H-H non adiacente che finisce per toccarsi abbassa l'energia della struttura. Raggiungi l'energia più bassa per risolverlo.
Protein Fold è un puzzle biochimico costruito sul modo in cui le proteine si ripiegano attorno a un nucleo idrofobo, il principio che dà alle proteine la loro forma.
Ripiegare una catena di residui idrofobici e polari in modo che quelli idrofobici si nascondano in un nucleo, assegnando punti a ogni contatto H-H non adiacente, è il modello HP su reticolo del ripiegamento proteico.
Valutare direttamente i contatti sepolti è la semplificazione originale.
È una semplificazione drastica che conserva la fisica essenziale. L'effetto idrofobico, cioè l'aggregarsi dei gruppi apolari perché ciò massimizza l'entropia dell'acqua circostante, è la forza dominante che dà forma a una proteina, quindi un modello che non contiene quasi nient'altro produce comunque ripiegamenti riconoscibilmente simili a quelli proteici.
Protein Fold è un puzzle biochimico costruito attorno a modelli di ripiegamento proteico con nucleo idrofobico. È un gioco browser originale e gratuito realizzato internamente per PlayPendium.